Škoda Kodiaq ponúka štvorvalcové benzínové a naftové motory v niekoľkých výkonových variantoch, vždy v kombinácii s automatickou prevodovkou DSG a pohonom predných alebo všetkých kolies. K dispozícii je jeden benzínový motor, jeden mild-hybridný variant, jeden plug-in hybridný benzínový motor a dva naftové motory.