Nároky na aktívnu i pasívnu bezpečnosť nových automobilov neustále rastú a tomuto trendu zodpovedá i aplikácia najmodernejších bezpečnostných prvkov vo vozidlách Škoda.
V krajinách EU je systém ABS vrátane MSR a podtlakového posilňovača bŕzd Dual Rate už štandardom a preto ho samozrejme ponúkajú v základe aj modely Fabia a Fabia Combi.
Zmenila sa však štruktúra ďalších “balíčkov“ elektronických asistenčných systémov jazdnej stability. K dispozícií je teraz paket ESP Plus (ESP, ABS, MSR, ASR, EDS, HBA, Dual Rate, kontrola tlaku v pneumatikách, asistent rozjazdu do kopca). Novinkou v modelovej rade Fabia je asistent rozjazdu do kopca, známy z modelov radu Octavia, Yeti alebo Superb.
Už v základnej výbave nechýbajú airbagy vodiča a spolujazdca a bočné airbagy vpredu so signalizáciou nezapnutého bezpečnostného pásu vodiča. Na prianie je možné vozidlo vybaviť i hlavovými airbagmi .
K ďalším bezpečnostným prvkom výbavy patria napríklad trojbodové bezpečnostné pásy (vpredu výškovo nastaviteľné), opierky hlavy vpredu i vzadu, príprava pre uchytenie detských sedačiek ISOFIX na zadných sedadlách, systém prerušenia prívodu paliva pri náraze a ďalšie bezpečnostné prvky.